برای استفاده از تمام پتانسیل GIS در سازمان ها نیز، نیازمند وجود یک نقشه راه GIS سازمانی هستیم. در بدو ورود GIS به سازمان، باید بدانیم که می خواهیم چه مسیری را برویم؟ از کجا می خواهیم شروع کنیم؟ در چه زمانی باید به کدام ایستگاه ها برسیم و با تغییرات تکنولوژیک و نیز تغییرات نیازهای سازمان، چگونه می خواهیم GIS را همراستا کنیم. این امکان پذیر نیست مگر با تدوین طرح جامع GIS سازمانی یا GIS Master Plan. به عبارت دیگر، طرح جامع GIS، یک سند راهبردی GIS است که به صورت جامع مشخص می کند GIS در سازمان ما الان چه وضعیتی دارد؟ GIS سازمان ما باید به کجا برسد؟ و چه طور باید به آنجا برسیم.