در این گام، وابسته به این که رویکرد شما در راه اندازی Web GIS متن باز باشد یا تجاری، می توانید از انواع نرم افزارهای مدیریت پایگاه داده که قابلیت کار با داده های مکانی را داشته باشند، استفاده کنید. نرم افزارهای Oracle و SQL Server از جمله نرم افزارهای پایگاه داده تجاری و نرم افزارهایی مثل PostgreSQL, MySQL, SQLite, MongoDB, H2 و… از جمله پایگاه داده مکانی متن باز می باشند.